ich finde der Motor selbst läuft recht rund und schüttelt sich nicht, zumindest sehe ich im Video vom Motor nichts.
In der Aufnahme mit der Wasserschale (gute Idee) hört und sieht man Vibrationen.
Für mich hört sich das so an, als wenn da etwas verspannt eingebaut wäre oder etwas aus dem Antriebsstrang am zB Rahmen anliegt, bzw eine der (Gummi-)Lagerungen defekt ist.
Mal die Verschraubungen (Lagerböcke) vom Schaltgetriebe und VTG lösen und das Ganze soweit bewegen, dass es spannungsfrei sitzt > wieder verschrauben. Dabei auch die Lagerböcke prüfen.

Der macht das ja scheinbar auch im Stand, bei entsprechender Drehzahl. Also könnte einer entsprechend Gasgeben und der andere unter dem Fahrzeug liegend horchen / fühlen wo es am deutlichsten ist.

Gruß Juergen