Die Verkehrsbehörde bekommt vom Hersteller (KBA-Tabelle im Rechner) oder Gutachter die Schlüsselnummern. Diese werden in Deine Papiere und den Rechner eingetragen. Das FA holt sich diese Daten und erstellt danach einen Steuerbescheid.
Beispiel: Du nimmst einen Defender 110 vom brit. Militär mit V8-Benziner. Du baust einen 300Tdi ein. Die Verkehrsbehörde übernimmt die neue Schlüsselnummer aus dem Umrüstungsgutachten, trägt sie ein und übermittelt diese ans FA für Dein Fahrzeug. Wenn die Verkehrbehörde dabei einen Fehler macht, ist auch der Bescheid falsch. Du mußt dann aber die Verkehrsbehörde anschei... und nicht das FA.